La ciudad de Yapeyú se encuentra en la provincia de Corrientes, en el departamento de San Martín en Argentina. Sobre las ruinas de la antigua reducción de Yapeyú, establecida en 1627 y destruida durante la Invasión luso-brasileña en 1817, se estableció en 1860 con el nombre de San Martín. En el año 1899, su nombre cambió a Yapeyú.
Situado en una región de colinas suaves en el este de la provincia de Corrientes, cerca del río Uruguay, que marca actualmente la frontera internacional entre Argentina y Brasil. La principal vía de comunicación con Yapeyú es la RN14, que se encuentra al oeste del centro de la ciudad. Se encuentra a una distancia de 401 kilómetros de la capital de la provincia.